گروه پژوهشي فلسفه و كلام از باسابقهترين گروه هاي پژوهشي دفتر خراسان بشمار مي آيد كه در جهت تعميق و توسعه انديشه ديني در حوزه معرفت فلسفي و كلامي، تبيين و دفاع از اعتقادات ديني و همچنين تقويت بنيان هاي فلسفي ـ كلامي نظام اسلامي در سال 1374 تأسيس گرديده است. بيش از يك دهه حضور و فعاليت پژوهشي مستمر، انجام بيش از پنجاه پروژه تحقيقاتي، انتشار هجده اثر پژوهشي شامل دوازده كتاب (كه برخي از آنها اثر برگزيده كشوري شدهاند)، طراحي، اجرا و انتشار شش پروژه در قالب هفت شماره از مجلات دفتر قم و نيز بيش از شصت مقاله مستقل در مجلات علمي ـ پژوهشي و ديگر مجلات معتبر كشور، و نيز برگزاري بيش از هشتاد همايش و نشست تخصصي در زمينه مباحث فلسفي، كلامي و فرهنگي كشور از مهم ترين دستاوردها و پيشينه هاي گروه پژوهشي فلسفه و كلام در دفتر خراسان مي باشد.
شاهراه اصلي پژوهش هاي گروه در حال حاضر پروژه اي عظيم با نام «راهبردهاي نوسازي فهم و معرفت ديني» مي باشد كه براساس موقعيت فراگير آن به عنوان ابرپروژه گروه درنظر گرفته شده است. اضلاع و محورهاي اصلي اين ابر پروژه به ترتيب عبارتند از سه كلان پروژه:
الف) روش شناسي مطالعات ديني.
ب) نظام هاي معرفت شناسي ديني.
ج) مدل هاي احياء و بازسازي تفكر ديني.
راهبردهاي نوسازي فهم و معرفت ديني، پروژهاي كاربردي و راهبردي براي تمام حوزه هاي مطالعات ديني محسوب مي گردد، و نسبت آن با علوم رايج ديني چون تفسير و فلسفه و فقه و كلام و غيره همچون نسبت منطق و متدولوژي به كليه علوم و معارف بشري است.